Marilyn Manson est perçu par le grand public comme un artiste dérangeant et provocateur. En effet, il déchaîne souvent les passions et semble travailler à ne pas inspirer l'indifférence. Les gens offensés par les paroles de Manson l'accusent de corrompre la jeunesse. Dans de nombreuses villes nord-américaines, protestations et pétitions l'ont empêché de se produire sur scène. Après le massacre de Columbine, beaucoup ont affirmé que c'était sa musique (avec d'autres du même style « gothique ») qui avait influencé Eric Harris et Dylan Klebold avant leurs meurtres, ceci malgré le fait qu'Harris et Klebold n'aimaient pas la musique de Manson. Dans le film/documentaire Bowling for Columbine, Michael Moore, le réalisateur, a donné la parole au chanteur au sujet de cette tragédie. Lorsqu'on lui demandait ce qu'il aurait dit aux deux tueurs avant leur crime s'il avait pu les rencontrer, Manson répondit calmement « Je n'aurais rien dit ; je les aurais écoutés, ce que personne n'a fait. »
Très marqué dans son enfance par une éducation religieuse très stricte, le chanteur a construit son identité de scène dans la contestation de l'Amérique puritaine et du dogme chrétien. Ses premiers shows étaient d'une extrême provocation idéologique et religieuse.
Quand Manson fut nommé Révérend de l'Église de Satan par Anton Lavey, son fondateur, il s'est attiré les foudres de certains croyants et puritains : interdiction de faire ses représentations dans certaines villes des États-Unis et du monde, horde de militants religieux priant pour sa rédemption devant ses concerts, tracts, procès...
Si le révérend est tant contreversé, c'est à cause de ses idées et de la manière dont il veut les faire passer. Ce que ne comprennent pas ses détracteurs c'est que l'oeuvre de Manson est à prendre entierement au second degrés car c'est une véritable parodie. Si l'on s'attarde un peu sur les paroles de ses chansons on distingue le commentaire de cette triste réalité. Même si la tendance Manson a l'habitude de se tourner vers le sexe, la violence et la drogue il ne fait pas des jeunes des sataniques.
Il ouvre les yeux de nombreuses personnes en leur faisant prendre conscience des défauts du gouvernement. Contrairement à ce que l'on pourrait croire, Manson ne fait pas que cracher sur les principes de son pays car étant donné que son oeuvre est une description, les côtés positifs de ce monde s'y retrouvent même s'ils sont beaucoup moins nombreux.
Au final, la philosophie de Manson ne peut que faire avancer les jeunes et les rendre plus matures s'ils s'intéressent à un peu plus que le look gothique du chanteur. Le but de Marilyn Manson n'est donc pas d'agresser les gens mais d'essayer de les faire réfléchir.